Data Engineer (ref. ATP-2024-275)
Het KU Leuven Institute for Single Cell Omics (LISCO), het KU Leuven Cancer Institute (LKI) en het KU Leuven Brain Institute (LBI) hebben samen een state-of-the-art spatial multi-omics platform opgericht, dat nu al een revolutie teweegbrengt in ons begrip van gezonde (bv. normale organen) en zieke weefsels (bv. kanker en neurodegeneratieve ziekten).
De opschaling van de integratie en analyse van spatial multi-omics data vereist nu een collaboratieve inspanning, waarvoor we een toegewijd team van datawetenschappers aanwerven dat bestaat uit nauw samenwerkende bioinformatici, softwareontwikkelaars, AI-specialisten en datamanagers.
Als onderdeel van dit team zoeken we een Data Engineer die zal worden ingebed in de onderzoeksgroep van Prof. Alejandro Sifrim, die het laboratorium van Multi-omic Integrative Bioinformatics leidt aan het departement Humane Genetica van de KU Leuven.
Het lab van Prof. Sifrim heeft een brede expertise in de ontwikkeling en implementatie van computationele methodologie voor de analyse van single-cell en ruimtelijke multi-omics, AI-gedreven onderzoek en high-throughput computing.
Functie:
Deze data engineer positie zal ingebed zijn in de groep van Prof. Sifrim, maar zal nauw samenwerken met verschillende KU Leuven instituten (Leuven Institute of Single-Cell Omics, Leuven Cancer Institute, Leuven Brain Institute) evenals de centrale KUL IT afdeling (ICTS).
Je bent verantwoordelijk voor de planning, ontwikkeling en implementatie van geautomatiseerde datastromen van de experimentele setups naar high-throughput computeromgevingen en data-archiveringsoplossingen.
Je stroomlijnt ook de traceerbaarheid, beveiliging en integriteit van zeer waardevolle datasets, met inbegrip van hun respectieve metadata.
Waar nodig draag je bij aan het datamanagementbeleid op institutioneel niveau (LISCO/LKI/LBI) en op universitair niveau.
Door de efficiëntie van deze datamanagementprocessen te verbeteren, draag je bij aan de voortdurende baanbrekende wetenschappelijke inspanningen.
De kernverantwoordelijkheden van de functie:
- Je plant, ontwikkelt en implementeert datamanagementstrategieën voor wetenschappelijke onderzoeksprojecten die grote hoeveelheden data genereren (d.w.z. 100 TB per experiment).
- Je fungeert als liaison tussen de verschillende KUL-instituten (LISCO/LKI/LBI) en KUL-diensten (KUL ICTS, VSC) op het gebied van datamanagementbeleid en -implementatie.
- Je plant, verwerft en bewaakt de nodige hardware-infrastructuur (in nauwe samenwerking met de ICT-diensten van de KUL).
- Je werkt samen met de onderzoekers, adviseert en assisteert hen bij de praktische implementatie van datamanagementprocessen.
- Je schrijft documentatie en ontwerpt opleidingen
- Je volgt actief trends en ontwikkelingen in Research Data Management
- Je blijft op de hoogte van onderzoeksbeleid, financiering en gerelateerde regelgeving in KU Leuven en Europa.
- Je hebt een masterdiploma in een studiegebied met een sterke focus op IT (informatietechnologie, computerwetenschappen ...) of gelijkwaardige kennis door ervaring.
- Enkele jaren ervaring in een onderzoekscontext is een plus.
- Je hebt kennis van en ervaring met methoden en technieken voor de verwerking van onderzoeksgegevens (bij voorkeur in het biomedische domein).
- Je bent vertrouwd met het beheer van onderzoeksgegevens, metadata en de FAIR data principes.
- Je hebt goede mondelinge en schriftelijke communicatievaardigheden.
- Je hebt gedegen kennis van Unix/Linux, inclusief ervaring met scripttalen (bijv. shell scripting).
- Je hebt aantoonbare programmeerervaring (bijv. C/C++, Python, Java, Perl).
- Je hebt ervaring met het gebruik van data management tools of bent bereid om snel kennis te verwerken (bijv. iRODS).
- Je bent een teamspeler en werkt resultaatgericht met gevoel voor orde en kwaliteit.
- Je spreekt en schrijft vloeiend Engels.
- Je hebt een sterk analytisch inzicht, bent pragmatisch en denkt oplossingsgericht.
- Je hebt een gezond verantwoordelijkheidsgevoel.
Wij bieden een full-time tewerkstelling voor onbepaalde duur in een stimulerende internationale werkomgeving, uitgerust met de modernste infrastructuur.
Ben je onmiddellijk inzetbaar in alle opdrachten van deze functie dan start je in graad 7. Beloftevolle kandidaten die nog niet alle opdrachten meteen kunnen opnemen of nog een specifiek opleidingstraject moeten doorlopen starten in graad 6. Graad 8 is uitzonderlijk
weggelegd voor kandidaten die reeds van bij de start, omwille van doorgedreven kennis en ervaring, extra verantwoordelijkheden kunnen opnemen. Daarnaast biedt KU Leuven nog heel wat extra's zoals ecocheques, extra vakantiedagen, groeps- en hospitalisatieverzekering, woon-werkverkier (gratis bus, trein of fietsvergoeding/leasing of e-bike), ruime opleidingsmogelijkheden ...
Je werkt in Leuven, een historische, dynamische en levendige stad in het hart van België, vlakbij de grote Europese hoofdsteden.
Meer informatie is te verkrijgen bij mevrouw Kim Nijs, tel.: +32 16 37 43 12.
Solliciteren voor deze vacature kan tot en met 26/06/2024 via onze online sollicitatietoepassing
KU Leuven wil een inclusieve, respectvolle en sociaal veilige gemeenschap zijn. Wij omarmen diversiteit tussen individuen en groepen als een meerwaarde. Open dialoog en verschillen in perspectief zijn noodzakelijk in een ambitieuze onderzoeks- en onderwijsomgeving. In ons streven naar gelijke kansen erkennen wij de gevolgen van historische ongelijkheden. Wij aanvaarden geen enkele vorm van discriminatie op basis van, onder meer, geslacht, genderidentiteit en -expressie, seksuele oriëntatie, leeftijd, etnische of nationale afkomst, huidskleur, levensbeschouwelijke overtuiging, neurodivergentie, arbeidshandicap, gezondheid, of socio-economische status. Bij vragen over toegankelijkheid of aangeboden ondersteuning helpen we je graag op dit e-mailadres.
KU Leuven
Parijsstraat 72b
3000 Leuven
België
